华夏军登陆之后，并没有急着进攻广州城，而是清除周边地区的抵抗力量。
都不用华夏军去攻打，宝安和东莞两座县城的天地会和小刀会起义，绿营兵纷纷投降，知县逃跑了，两座县城的起义军立即带着效忠书来投奔华夏军。
早已被天地会渗透得千疮百孔的顺德、香山两县的绿营清军宣布起义，剪掉辫子，降下大清龙旗，升起日月旗，宣誓加入华夏军。
陈新元只派遣了几个人，就接受了顺德和香山两地的原绿营清军，这些起义的清军和虎门炮台、沙角炮台、威远炮台等炮台的投降清军一起，被编入了华夏军第二军第四师。陈新元自己兼任华夏军第二军军长，第二军第四师师长由原绿营清军总兵陶煜文担任。
之前陶煜文在大屿山之战中曾经被俘，后来家里人付了赎金给赎了回去。这次华夏军进攻广东，陶煜文果断的宣布起义，干脆利落的投奔了华夏军。
作为第一名主动起义的清军总兵，陈新元自然是十分重用，毫不犹豫的给了他师长职务，打算以此来作为榜样，号召清军主动投降甚至起义。
白云山起义的天地会起义军，和各地的天地会起义军，部编入华夏军第一军第三师，由周春担任师长。
原本陈新元是打算让石达开担任第三师师长职务，可是考虑到石达开太年轻了，才19岁，就担任师长恐怕不能服众，所以让周春担任师长。
自此，华夏军陆军拥有了四个师的兵力，第一军军长苏三娘，兼第一军第一师师长，第二师师长罗大纲，第三师师长周春，第二军军长由华夏军总司令陈新元兼任，第二军第四师师长陶煜文。
华夏军总司令陈新元自任，总参谋长左宗棠，后勤部部长肖柏。
新成立的第三师和第四师装备都比较差，洋枪的普及率未能达到100，只有少数洋枪，大部分仍然是大刀长矛。而且由起义绿营清军组成的第四师，兵员素质不一，很多兵年龄太大的，都被陈新元要求退役，编入地方武装之中，留下来的兵必须经过严格训练，合格的才能成为华夏军。
而第三师的兵其实也差不多，素质参差不齐，陈新元对那些天地会起义军也是一样对待，经过考核，不合格的部丢去地方。
为了解决那些被淘汰下来的起义军士兵的去处，陈新元在各县城成立了民兵，用来维护地方治安。
华夏军在清理广东外围的抵抗时，遭遇到最大的抵抗并非是清军的抵抗，而是一些当地士绅组织的民团负隅顽抗。
“我们已经发出公告了，说要善待读书人，就算是旗人，我们都可以招降了，怎么还有一些士绅要反抗我们？”陈新元对此觉得很不可思议。
左宗棠笑着道“那是因为那些士绅家里有人在朝廷里面当官，譬如说罗天池、蒋理祥、梁廷枬之类的，他们不是自己又进士的功名，就是家里人有进士功名，舍不得丢弃清廷给他们的功名，自然是会反抗我们了。”
“螳臂当车罢了！”陈新元冷哼一声，“既然他们顽固不化的要为清廷殉葬，那我们就成他们好了！杀人我们可以少杀点，但是这些劣绅的天地家产，要部充公！他们想要效忠大清国，那就让他们效忠去吧。”
经过一番激战，华夏军平定了蒋理祥和罗天池的民团，蒋理祥、梁廷枬、罗惇衍和罗天池等民团首领被俘虏。
蒋理祥是被何六的天地会起义军击败了，俘虏了蒋理祥后，何六不敢自行处理，于是蒋理祥被押到了陈新元面前。
“蒋举人，你为何要螳臂当车，阻拦我军收复广州？”陈新元问道，“难道之前你都没看过我发的报纸吗？我不会亏待你们读书人的。”
“呸！”蒋理祥呸了一声，“我等读得圣贤书，自然是要忠君报国！岂可从逆！”
“既然你死不悔改，那我也不会一刀杀了你，那也太便宜你了！岂不是刚好成了你忠君报国的名声？给了其他读书人做了榜样？哼！来人啊！把蒋理祥押入大牢，所有田地财产部充公没收！”陈新元喊了声。
早已剪掉辫子，投奔了华夏军的衙役走上来，像是抓小鸡一样扭住了蒋理祥，任凭他挣扎喊叫，把他拖了下去。
接下来，梁廷枬、罗惇衍、罗天池和吴梯等士绅的民团被击败之后，这些人被依次送到陈新元面前。